白鸟，高木两位警部带兵进击黑衣组织与ZOO宝石犯罪集团的据点。FBI派遣朱蒂过来增缓，ZERO派风见过来增，OPIC派白马探过来增援，毛利侦探队派犬伏侦探过来增援。目暮带着一科高木长介来增援，阿笠情报组派怪盗基德过来增援，目暮的部下千叶带着特搜一科警员和SAT与IS特别行动队前来支援特搜一科，特搜二科带领机动队和配枪警员支援怪盗基德与白马探。
琴酒在据点布置了科伦和基安蒂两位狙击手，带领黑衣组织与ZOO宝石犯罪集团准备阻击警方与日本公安警察和FBI.ZERO.OPIC与毛利侦探队，同时让蜘蛛对付怪盗基德。
犬伏一伸根据多年对付大型犯罪集团的经验，让SAT和IS特别行动行动队狙击手追踪科伦与基安蒂两人的位置，忽然上级毛利小五郎传来情报，情报里说还有一个叫琴酒的人员是狙击手，能与FBI王牌赤井秀一势均力敌。江户川柯南已经让他过去帮助你们，沉住气，你跟白马先行进攻，小心琴酒。
十分钟后，SAT和IS特别行动队对科伦、基安蒂两人进行压制，朱蒂闯进黑衣组织中的一个仓库，在仓库中与伏特加展开枪战，最后伏特加成功逃跑，蜘蛛遇到怪盗基德与白马，三人展开激战最后蜘蛛侥幸逃脱，SAT和IS特别行动队压制科伦与基安蒂两人失败，两人向SAT和IS特别行动队射击，子弹即将打中SAT两名队名被风见用枪打下，犬伏一伸解决一名ZOO成员，成功逼退黑衣组织一名A级成员跟风见，目暮，朱蒂汇合，三人即将直捣黄龙踹掉黑衣组织与ZOO宝石犯罪集团的据点，遇到琴酒，琴酒用枪向目暮警部射击，千均一发之际高木涉和赤井秀一及时出现，高木涉用枪打下琴酒射出的子弹，赤井秀一用狙击枪射击琴酒，子弹被琴酒躲过，琴酒再度射击，子弹差点打中目暮警部，由于犬伸一伸带着毛利小五郎给他们配备的手枪，犬伏一伸快速用枪把琴酒射出的子弹挡下了。琴酒只能带着黑衣组织与ZOO宝石犯罪集团成员撤退。目暮警部刚想追，就被犬伏一伸，风见，赤井与朱蒂四人拦下，四人跟目暮警部说道“穷寇莫追。”黑衣组织与ZOO犯罪集团的一些成员在撤退中遇到服部平次从大阪带来的大阪SAT一队的阻击，除琴酒和一些正武成员逃出包围，琴酒与蜘蛛等人逃跑之外。目暮警部，犬伏一伸，赤井，风见四人在黑衣组织的据点走出来，出来后遇到服部平次在等他们，高木涉，白鸟任三郎，怪盗基德与白马探先后出来，原来这四人在特搜一科SAT和IS特别行动队与特搜二科的支援下，解决了黑衣组织和ZOO宝石犯罪集团一波成员，四人将被他们制伏的黑衣组织与ZOO宝石犯罪集团成员带了出来，四人见到了来接应他们的服部平次。高木涉四人跟目暮警部汇合，目薯警部在FBI.ZERO.OPIC与SAT.IS特别行动队，大阪高校生侦探服部平次与大队SAT的支援下将黑衣组织成员与ZOO宝石犯罪集团带回警视厅审问，高木长介和千叶一伸在目暮警部汇合中逮捕两个成员，两人出来跟回暮警部汇合，返回警视厅，朱蒂，赤井两人回FBI报道，风见回警察厅报道，犬伏回毛利侦探队报道，目暮，高木长介和千叶一伸回警视厅，白鸟，高木涉象征性跟目暮警部报道，回到阿笠情报组报道，白马回OPIC报道，服部平次带着大阪SAT一队全体成员坐上东京至大阪的特快车返回大阪警察本部报道，服部平次等人回到大阪，服部平次将大阪SAT带回警察本部，服部平次跟他父亲服部平藏汇报了这次行动，服部平次在警察本部门口租了一辆出租车，让出租车带自己返回居住的别墅。
