在东边区域，柯南一行人抵达后首先进入了档案库。库内有几只丧尸在游荡，哆啦小子和小五郎迅速清理了它们，其他人则立即开始翻阅资料。风间和小新骑在广志肩上，在书架上找到了一本《X光使用说明》；妃英里和柯南则发现了研究所的基地分布图。
小新翻着手里的资料问道：“X光，是医生常用的那个吗？”
“感觉找到了没什么用的东西。”风间有些失望。
“……先带着吧，说不定以后能用上。”广志说道。
妃英里拿起分布图，向大家说明研究所的结构：他们目前位于地下一层，放映厅在第零层。地下一层主要包括档案区、宿舍区、X光照射区、休息室、小研究室和动力室；地下二层设有研究室、培养室、武器库和主控室等重要设施；地下三层被划为机密研究室，代号T-002的“暴君”就存放在那里；而地下四层则有安布雷拉设置的逃生列车。
“……如果出现突发情况，也许这辆列车能带我们离开。”妃英里分析道。
“英里阿姨，还有其他信息吗？”柯南追问。妃英里注意到，小研究室具备开放动力室和培养室的权限；动力室启动后，会开放地下三层和主控室的权限；而主控室则控制着地下四层和列车的启动。要继续深入调查，他们必须先进入小研究室解锁其他区域。但资料显示，小研究室的钥匙存放在放映室的保险箱里，没有密码无法打开。
“密码……”柯南陷入沉思。这时，小新想把《X光使用说明》递给广志，却不小心手滑，册子砸在广志脚上。广志疼得直叫时，从册子里掉出了一张纸条和一张X光片。小新捡起来问道：“这是什么呀？”
“我看看。”哆啦小子接过纸条和X光片，“这应该是X光片，而这张纸条……”他看不懂纸条上的内容——上面写着“C+B-HxT”这样的符号。
小五郎接过纸条看了看：“这很明显是加减乘除的谜题吧。”
“加减乘除？但这些字母代表什么？”哆啦小子不解。
小五郎摸着下巴推理：“也许研究所里有什么东西和这些字母有关，需要用它来计算。”
“有了！翻翻这里的书说不定能找到答案。”小五郎看向满架书籍，但妃英里很快打断了他的想法：
“我觉得这里的人不会大费周章设计这么复杂的东西吧。”小五郎虽然尴尬，但也觉得有道理。
这话却提醒了柯南。他想起之前看的安布雷拉生物兵器档案中，怪物名称都是用英文加日文标注的，部分生物兵器的英文缩写或许能对应上。柯南立即拿起通讯器联系放映室那边：
“小兰姐姐，听得到吗？”
“柯南，是出什么情况了吗？”小兰回应。
“能麻烦小兰姐姐打开那个碟片吗？”
“碟片吗？”小兰走过去打开了放映机。
柯南对小五郎说：“叔叔，麻烦把纸条给我。”
“你小子，要这个干嘛？”小五郎疑惑地递过纸条。柯南将纸条上对应的字母和运算符号告诉小兰。小兰依次从“地狱犬”、“变色龙”、“猎杀者”、“暴君”的资料中提取数字进行计算，最终得出密码“28”。得到密码后，小兰打开了保险箱，却发现里面还有一个更小的保险箱。这个保险箱没有密码锁，取而代之的是一个12宫格谜题。
“柯南，我们这里出了点状况。”
“怎么了？”
“里面还有一个保险箱，而且这个谜题好像是格子谜题。”
“格子？”柯南也感到疑惑。
放映室这边，Sans走上前看了看12宫格，摊手说道：“应该是要我们点亮全部格子吧。”
“这种十二宫格谜题，在22世纪已经算很老的电子锁了。”哆啦美看着电子锁说。
“那姐姐，你能解开吗？”阿呆问道。哆啦美无奈地摇头：
“抱歉，因为这款电子锁基本被淘汰了，22世纪没有录入它的破解公式。”
“我来试试吧。”Ink自信地上前开始破解。他点击一个格子，亮起三格，熄灭的两格呈十字状排列。Ink继续尝试，但三分钟过去了，他仍然没有解出来——每次试图点亮某些格子，总会意外熄灭其他的。多次失败后，Ink失落地站起身：
“抱歉，让大家失望了。”
这时，小葵咿呀地摆着小手看向保险箱，明显想试试。美伢见小葵感兴趣，问道：“小葵想试试吗？”小葵点了点头。美伢抱着她走到保险箱前，小葵伸出小手开始点击格子。令人惊讶的是，仅用了30秒，十二宫格全部亮起，保险箱“咔嚓”一声打开了，里面露出一把钥匙。小葵开心地笑起来，美伢惊喜地喊道：
“打开了！”
“什么？”其他人闻声围过来。看到保险箱真的打开了，美伢抱起小葵称赞：
“小葵好厉害！不愧是我的女儿！”
小葵红着脸，傻笑着捂住后脑勺。小白、阿呆、哆啦美和小兰也在一旁鼓掌叫好。只有Ink似乎受了点打击，蹲在角落里沉思。Sans见状吐槽道：
“也没见你这么较劲啊。”
拿到钥匙后，Sans决定独自去打开小研究室。进入地下一层，他用骨刺轻松解决了游荡的丧尸，用钥匙打开小研究室的门。走到电脑前，他发现需要账号权限才能操作系统。Sans拿起通讯器联系柯南那边：
“我打开了小研究室，不过似乎需要账号权限，你们那里有线索吗？”
“我们这里没有找到其他线索，不过倒是找到一张X光片。”哆啦小子回复。
“X光片……你们看看能不能在那张‘露骨’的东西上找到点线索。”Sans用他特有的幽默语气说道。
在Sans的提醒下，柯南等人仔细查看X光片。片子上显示的主人是一位名叫“铃”的女性，但光有这个信息还不够。他们决定离开档案室继续调查。
来到宿舍区，两只猎杀者发现了他们，张开利爪猛冲过来。
“麻烦，居然是这种怪物。”哆啦小子抬起空气炮攻击，其他人也举枪射击。但猎杀者坚硬的外皮挡住了子弹，继续扑来。一只猎杀者率先跃起，哆啦小子眼疾手快，一炮打碎了它举起的利爪。小五郎趁机抓住猎杀者的身体，用尽全力将它甩向另一只猎杀者。两只怪物撞在一起，昏厥过去。
“呼！呼！这臭蜥蜴真重。”
“趁它们昏迷，赶紧解决。”哆啦小子说着，立即用空气炮轰碎了猎杀者的脑袋。
解决猎杀者后，他们开始逐一调查宿舍区的房间。除了零星的丧尸和尸体，大多数房间都没有有价值的东西。直到小新在一个房间里发现一具奇怪的尸体，手中紧抓着一个沾血的信封——看起来像是情书。
“有情书诶！”小新走过去拿起了情书，风间急忙阻止：
“小新！不要随便摸尸体啊！”
但小新已经取下了情书。拆开一看，内容大致是一位名叫“大树”的研究员向“铃”表白，并提到自己即将变成丧尸，因此选择自杀。乍看像是遗言加表白，但小新读着读着皱起了眉头，问广志：
“爸爸，上面的‘RIN’和‘AKIRA’是什么意思？”
“我看看。”广志接过情书，只看一眼就兴奋地大叫：
“啊啊啊啊啊！！！”
“怎么了？”所有人都看向广志。他举起信封喊道：
“找到第一层权限密码了！”广志解释说，小研究室的权限账号是“大树”的英文名“AKIRA”，而他爱人“铃”的英文名“RIN”就是密码。
这时柯南注意到信封背面还有信息：“叔叔，信封背面还有字。”
“还有？”广志翻过信封，上面说明这只是大树自己的账号；要解锁更多房间的权限，需要将他和铃的名字在X光片照射下对应的符号作为暗号。信封上标注的密码符号是“+@+*”。
“也就是说，现在我们还需要找到一张X光片。”妃英里总结道。话音刚落，小新已经从大树的尸体上摸出了他的X光片。
“找到了！”广志和风间对小新的行为已经无话可说。
拿到X光片后，他们立即前往X光照射区。凭借之前找到的《X光使用说明》，在柯南的指导下，他们很快破译出了最终密码：“ADAM”。
“ADAM，我知道了。”Sans通过通讯器得知密码后，立即登录系统输入密码。各区域的权限依次开放，地下一层的探索基本完成。
正当Sans松口气时，电脑屏幕突然弹出一串字母。他疑惑地看着那行字——上面写着：
Horror
（未完持续…）
