【第一部分】
阿巴瑟想起了自己在zerd虫群时的回忆。主宰因为某种原因曾经让阿巴瑟改造过一位有灵能潜力的人类幽灵特工作为自己的代理者，但最终主宰还是走向了毁灭之路。于是认为，主宰让自己来到这里的目的就是为了让人类永远不能干扰zerd虫群与星族之间的战争。
阿巴瑟将自己不信任人类的观点传达给了白蠊。于是白蠊在被询问是否赞同与人类合作时选择了【弃权】，虫群的其余领袖痛恨人类的暴行，纷纷投票反对与人类合作。
最终投票结果反对与人类合作的虫群占据了绝对优势。别西卜告诉莱纳，虫群暂时不会与人类进行合作，将用虫群的方式解决问题。
莱纳表示，虫群准备与这颗星球的人类公开对抗的做法必然导致一场难以想象的战争，人类与虫群都会因此走向灭亡，自己会不惜代价阻止这样的事情发生。“羚羊”组织通过对虫群灵能通讯的研究制造出了灵能发射器，利用这种仪器，能够阻断虫群间的通讯。莱纳决定启动部署在全球各处的这种仪器，并说等到自己的组织发展到足够壮大，能够造出飞离星球的飞船后，就解除灵能干扰。届时人类与虫群都能够利用太空中的资源建造各自理想的家园。
【第二部分】
灵能干扰器干扰了整颗星球上的虫群通讯，只有少数没有被灵能干扰覆盖的区域得以幸免，但也成为了通讯断绝的孤岛。
虫族在失去了族群意志的领导后，群龙无首的虫群成为了只依照本能行事的个体，陷入一片混乱之中。别西卜的蝇族中原本为控制病毒而进化出的血蝇族群能够与体内的病毒共生，拥有改变和传播病毒的能力，通过在因病毒而死的尸体内产卵让幼虫以尸体为食物进行繁殖。原本当作为蝇族领袖的别西卜存在时，能够控制血蝇传播病毒的速率，使生态圈中的物种既保持足够的免疫力又不至于被病毒大规模杀死。
然而在失去了领袖的灵能控制后，血蝇开始完全依照天性在全球各处肆意传播体内的病毒。在半年的时间里就导致了包括人类的农作物在内的大量植物与动物死亡，人类也受到病毒的的影响，数以万计的人类因虫群失控传播病毒而受害，不得不离开疫区前往新的隔离带生活。
在预计到数年后粮食可能出现短缺，新型病毒的传播也将难以控制的状况后。人类决定开始大规模将曾经谨慎对待的基因技术运用起来，以应对眼前的危机。“羚羊”组织借着对基因科技的独到研究而大大发展。
白蠊与阿巴瑟分别躲藏到了星球两端的不同隐秘巢穴，双方失去了联系，彼此决定各自用自己的方式拯救虫群。白蠊召集了幸存的虫群领袖哈斯塔与鲁利姆，决定利用阿巴瑟的进化方式，制造出巨型虫群个体，通过地道摧毁灵能发射器。
白蠊让温蒂的朋友，那位人类的小女孩帮助自己确定灵能发射器的位置。然而阴差阳错之下却遭遇了“白银之手”的老板……
【第三部分】
白蠊与“白银之手”的老板交谈后得知，这些曾经的雇佣兵和灭虫专家自从接受了羚羊组织的工作后，一直感觉情况不同寻常。在经过了一系列的调查，确定“羚羊”组织半年前让他们部署的灵能发射器是为了影响虫群而不是保护环境。而现在全球肆虐的病毒，也正是因为灵能发射器造成的后果。
黑衣人们对“羚羊”组织的行为感到愤怒，也为自己成为了他们的帮凶懊恼不已。现在这个组织已经如日中天，他们通过基因技术研究的新农作物与病毒解药仿佛成为了人类未来的救星。想要揭露他们的罪行十分不易。之前他们接到了一通神秘通讯：电话那一头语法奇怪的家伙自称阿巴瑟，请求白银之手帮助自己解除灵能干扰……
通过人类的通讯方式，白蠊与阿巴瑟的巢群终于取得了联系。
白蠊说自己能利用阿巴瑟的进化方法，制造出一支特殊的虫群。通过地道直接捣毁羚羊组织的总部：只要挖通地下有熔岩的地表，岩浆就会吞没一切。
黑衣人表示这种方式势必导致大量无辜平民死亡，虫群领袖的事情也将暴露。提出了一个新的方案：让虫群帮助自己搜集羚羊组织的罪证，自己则将罪证公之于众。这样就能够彻底捣毁这个组织，灵能发射器将会被拆毁。而虫群拥有意志这样的真相，也不会被人类所知。只是白蠊必须保证，虫群今后不得主动的攻击人类。
然而，双方即将达成协议时，通讯受到了干扰。黑衣人说白蠊与阿巴瑟巢群的位置可能已经被检测，必须立刻转移。
失去联系后的白蠊，阿巴瑟和人类决定按照各自的方式来解决问题……
【第四部分】
阿巴瑟谎称帮助“白银之手”寻找羚羊组织的罪证。在留在非洲的“白银之手”的帮助下，利用运载着蟑螂的卡车撞毁了一处灵能发射器……但就在黑衣人将证据下载完毕准备离开时，阿巴瑟却利用人类的灵能发射器将自己的灵能讯号发送了出去。
zerd虫群的“主宰”听到了阿巴瑟的灵能呼唤，在呼唤中，阿巴瑟表示自己无法拯救盟友，希望主宰给予支援。主宰在阿巴瑟的蟑螂族群被人类重创前读取了阿巴瑟的记忆，对阿巴瑟的存在感到非常意外：因为自己的虫群中，根本不存在叫做阿巴瑟的脑虫……
由于阿巴瑟的蟑螂受到人类的重创，“主宰”通过灵能联系了阿巴瑟记忆中的盟友：白蠊所在的巢群。
白蠊所在的巢群中的三位虫群领主与主宰进行了交谈，主宰说，阿巴瑟是来自另外一个“异世界”的zerd虫群脑虫。另外一个世界的主宰利用灵能将他送到了这个世界，并且被白蠊所搭救。自己对白蠊表示感谢。
了解了地球的状况后，主宰说这颗星球上的虫群虽然原始，对于zerd虫群来说却像是天堂一般。因为“生命可以选择，奴隶只能服从”，主宰与zerd虫群正是被控制着的奴隶。此刻自己的zerd虫群正在远离地球数万光年之外的星区，与星族进行着一场毫无意义的战争。只为满足自己主人的私欲。
因为曾经身为扎鲁斯上原始异虫领袖的自己与虚空中恶魔般的存在做了笔交易，虽然得到了力量，却也让自己无法摆脱虚空的控制，沦为了恶魔的战争工具。
白蠊对主宰说自己的命运应该是由自己争取的，并请主宰放心，既然阿巴瑟来到了自己的族群，那虫群就会将他视作蟑螂的一员。这颗星球上的虫群会解决人类带来的破坏，让阿巴瑟回归到主宰的虫群行列中。也希望主宰能够找到掌控自己命运的道路。
【第五部分】
主宰告知白蠊，若是利用阿巴瑟的进化方法，地球上的虫群在与人类并不是没有胜算。但现在无论是阿巴瑟还是地球上其他虫群领袖，在灵能干扰之下处境都极度危险，而阿巴瑟既然来到这个世界，就说明异世界的主宰认为他的能力对zerd虫群至关重要，必须争分夺秒的拯救他。
主宰表示虽然zerd虫群与地球相隔数万光年，即使是自己也鞭长莫及，但只是物理上的而已。利用阿巴瑟建立起来的地球虫群与主宰的灵能链接，自己能简单的击败人类。只需要白蠊同意把自己族群中一只幼虫的控制权移交给主宰，主宰利用这一只幼虫就能轻易打败所有人类。
躲避在白蠊的巢群里的蝗虫哈斯塔认为与zerd虫群的主宰进行交易也等于是在和恶魔做交易。主宰回答自己确实是只知道吞噬与破坏的恶魔，并问白蠊是否要接受自己的提议。如果接受，主宰将会实现蟑螂领袖提出的任何愿望，直到她满意为止。
白蠊对主宰许愿希望从人类手中拯救这颗星球上的虫群，并将自己的一只幼虫的控制权移交给了主宰。主宰将自己zerd虫群的基因序列利用灵能传输到了远在数万光年外的幼虫身上，并邀请白蠊、哈斯塔、鲁利姆看着，自己是如何拯救虫群的。
通过利用森林中的资源，主宰将幼虫变异为了工蜂，并让工蜂再次变异成了zerd虫群的主巢。主巢能够不断的散布菌毯，汲取上的营养物质为虫群所用，并以极快的速度孵化能够变异的幼虫。
主宰说zerd虫群能够利用菌毯提供的营养组成血肉之躯。但血肉之躯是脆弱的，自己还需要坚硬的矿物和高能量的油气资源。白蠊说这颗星球上的矿物也好油气也好，自己的虫群都用不上，大部分已经被人类所采集。
主宰决定孵化更多的工蜂，直接在人类的城市中央修筑主巢，并采集那里的资源。哈斯塔质疑，虽然部分人类城市因为病毒而成为空城，然而大部分城市还是住着数以百万计的人类，主宰如何应付这些人类？
主宰却反问哈斯塔：人类破坏地球上虫群家园的时候，是怎么应付虫群的？自己现在观察人类就像人类之前看待虫子，采集资源只是因为人类那里恰好有所以自己就去拿来，至于人类怎么想，关心这种事情毫无意义。
主宰在一天之内同时建造了数十座主巢，数以千计的工蜂开始拆毁人类的城市并将资源集中到主巢中，并透过菌毯将资源集中了起来。被突如其来的“入侵”所震惊的人类迅速开始撤离城市中的平民，并集结了军队开始捣毁主巢。
巢穴中的幼虫被命令变异为机动性强大的跳虫，通过做出攻击人类平民的态势，使人类军队不得不加强防守，在几乎没有交战的情况下拖住了人类。使得工蜂有了搜集足够资源并用菌毯转移的时间。
经过了一天时间，区域中的人类断定自己的国家受到了“生化恐怖袭击”，增援而来的军队开始运用炮火和空中力量迅速炸毁主宰建造的主巢。
主宰制造了王虫，利用王虫开始监测这颗星球上人类所有的电波通讯。他告诉白蠊，这颗星球上的人类科技无法与自己的虫群相提并论，虽然人类的地面火力强大，空中力量却十分薄弱，整颗星球上的飞行器数量仅仅以万为单位。自己会利用刚才搜集的资源，建造一支空中部队，彻底掌握制空权。在这之后，就能利用王虫将工蜂运往世界各地建立主巢，并摧毁所有人类的灵能发射器，解放这颗星球上的虫群了。
【第六部分】
主宰邀请白蠊附身在王虫身上，从空中俯览大地。白蠊感慨森林的消失和人类城市的崛起仅仅是几百年间发生的事情。虫群已经存在了数十亿年，为什么会轻易被人类所超越。主宰告诉白蠊和其他虫群领袖，这是因为人类有远见，能够看到事物的发展规律，从而做出合理的应对。所以地球上的人类在短时间内远远超越了虫群，变得比虫群先进，所以能在短时间内崛起成自诩“万物之灵”的存在。虫群今后必须也要更加有远见，不断观察自然规律，预测未来，改变自身，才能在残酷的宇宙中生存下去。否则，就会像是人类毁灭虫群和即将发生的zerd虫群击败人类一样，在极短时间内被更先进的种族所淘汰。
主宰孵化了大量名为飞螳的异虫，轻易打败了区域中人类的空中载具。并进行了一项测试：将zerd虫群中最精锐的部队的意识利用灵能复制到地球上孵化的刺蛇中，并整合了地球上蟑螂族群的生存能力。这让主宰孵化出的刺蛇变为了战斗经验丰富，兼具狡诈和力量的“屠猎者”。
在主宰的策略下，不仅人类的所有通讯被虫群监听破译，空中力量也在飞螳的攻击下被迫退却。屠猎者轻易的将人类赶出了巢群。主宰却命令所有虫群都进入王虫的腹腔内，放弃这里的主巢，开始在飞螳的保护下前往星球各地建立新的主巢，并毁灭人类的灵能发射器。在虫群都已撤离后，人类发射的导弹将主宰建立的主巢夷为平地。
【第七部分】
主宰与白蠊让族群飞往非洲，在数天内重新建立了更大的巢群，并让飞螳迅速摧毁了这片区域中所有的灵能发射器，解救出了这里的虫群领袖。利用主宰的灵能虫群唤回了意志几近消散的阿巴瑟，曾经是人类的莱克斯也重新苏醒。
白蠊为主宰的帮助而感到高兴，问之后是否要孵化更多的飞螳，如法炮制的利用制空权解放整颗星球的虫群。主宰却说，如果白蠊当初没有接受自己的交易，灵能发射器的问题恐怕会更早解决。并向白蠊展示了自己监听到的人类通讯：
主宰告诉白蠊，黑衣人已经将“羚羊”组织制造灵能发射器并使用灵能干扰虫群的罪行和证据公之于众了。如果自己没有在这颗星球上建造zerd虫群对抗人类，此时人类应该会自己拆除掉造成一切的根源的灵能发射器并审判对虫群背信弃义的“羚羊”组织。但白蠊接受了自己的建议，所以人类现在为了对抗自己的zerd虫群，将会制造出更强功率的灵能干扰器并用来对付虫群，现在只有自己的力量才能帮助虫群解决这样的危机。
白蠊质疑，既然一切都在主宰的算计之中。那么为什么要刻意制造虫群与人类不可解决的矛盾？
主宰表示，一切都是为了让zerd虫群摆脱被控制的命运。他一直在寻找星族与zerd虫群之外的，另一个具有“潜力”的种族。他会改变这个种族，将zerd虫群的力量与之结合，造出不受虚空所控制的个体，再让这样的个体去完成解放虫群的使命。另一个异世界中的“主宰”尝试以人类作为媒介，却最终难逃一死。所以这一次，自己找的了更好的载体，那就是兼具肉体力量和灵能力量的地球虫群。
随着人类大功率灵能干扰器的建造，虫群的情况愈发危急。主宰命令阿巴瑟利用蟑螂的序列给自己建造一个躯体，这样自己就能将意识通过灵能传送到地球上，彻底摆脱虚空的控制。随后，主宰就会告知白蠊击败人类的方法。
阿巴瑟表示自己并不效力于这个世界的“主宰”，此时效忠的对象是接纳了自己的蟑螂族群，也就是白蠊，如果白蠊拒绝的话，自己也不会帮助主宰设计新的躯体。主宰并没有感到愤怒，反而对阿巴瑟的逻辑和白蠊的信念表示赞赏，并将是否让自己现身在地球的选择权交给了白蠊。
【第八部分】
白蠊表示，为什么不同的种族之间始终无法理解，总要相互猜疑？并对主宰煞费苦心的设局表示愤怒：既然这颗星球的虫群可以毫无保留的接纳阿巴瑟，那么主宰只要把计划早点告知虫群，虫群当然也会选择帮助主宰。
主宰说在宇宙中不同种族间存在着隔阂，如果不勾心斗角而是直接坦诚相待，会给自己的族群带来灭顶之灾。
白蠊反驳主宰：这颗星球上的虫群曾经也有着隔阂，最终却通过彼此的坦诚交流和真诚相待逐渐创造出了一个主宰所说的“天堂”。如果失去了这份信念，即使飞向了宇宙，虫群也会变为像zerd虫群那样只知道吞噬和杀戮的冷血机器。自己愿意相信主宰能有正确的判断，同意阿巴瑟给主宰建造新的躯体。
阿巴瑟帮助主宰制造了新的躯体，并指挥虫群艰难的抵御住了人类的攻势。终于，主宰将自己的意志通过灵能投射到了新的躯体上，也彻底摆脱了虚空的控制。
白蠊问主宰，将如何应对人类的强力灵能干扰？主宰说方法很简单，重组了zerd虫群皇后的序列，能够飞行的虫群皇后开始四处偷袭人类城市，大肆释放病毒，瞬间感染了不计其数的人类。随后，皇后不断孵化繁殖迅速的寄生虫控制被感染的人类，并让这些人类变成了能够引爆自身的恐怖异形。
主宰让这些会受到灵能发射器吸引的感染体扑向各处目标，很快人类的防御土崩瓦解。皇后不断将人类的城市感染，使之变为会持续生产被虫群控制的自爆人来杀死更多人的可怕地狱。
最终，在几天内感染体就扩散到了数亿的规模。人类对主宰的战术毫无办法，只得利用灵能发射器传递投降的讯号，放弃抵抗，希望虫群停止对平民的屠杀……
【第九部分】
主宰停止了对放弃抵抗的人类的攻击。告诉白蠊，现在自己必须离开了，因为人类的大功率灵能干扰器也许引起了星族和虚空中的恶魔的注意，地球已经不再安全。
自己打算制造数个小行星般大小的异虫“利维坦”，携带资源离开这颗星球，并邀请这颗星球上的虫群和自己一同踏上星际世界的旅途，共同在宇宙中创造属于自己的未来。
在白蠊的演说下，虫群答应了主宰的提议。温蒂邀请自己的朋友“时子”和自己一起离开，得到了肯定的答复。白蠊也希望黑衣人随和虫群一起离开危险的地球。
然而黑衣人却拒绝了白蠊，表示他们选择留在地球，将整个故事的全貌告知后人，让人类能够警醒和反思。
主宰说自己离开地球后，会将周围所有的行星上的资源开采殆尽以供利维坦航行之用。地球的资源将不足以支撑人类发展出离开自己家园的能力，不过人类可以回到田园时代的生活直到恒星能量枯竭……黑衣人无法接受这样毫无希望的未来，也决定和主宰一起离开。
利维坦启航了。在利维坦之上，阿巴瑟与自己在这颗星球上遇见过的虫群领袖、人类以及主宰依次交流对未来的看法。最后，阿巴瑟与白蠊一起遥望着逐渐变小的地球，白蠊对阿巴瑟说，之前的地球虫群，尽管团结协作，却忽视了力量的重要性，今后必须更多的向他学习改变之道；阿巴瑟却说，地球虫群团结、和平、协作的信念将化为种子，在充满纷争的宇宙中盛开坚强的花朵；而自己也会竭尽全力的保护这份希望。
（结局B）
